Secara administrasi wilayah kerja Puskesmas Ngaliyan berbatasan dengan:
Topografi wilayah Puskesmas Ngaliyan rata-rata memiliki elevasi 50 m dari permukaan laut (dpl)dengan kelerengan 2-5 %. Berdasarkan data ketinggian elevasi permukaan tanah dan kelerengan tersebut menjelaskan bahwa di wilayah Puskesmas umumnya merupakan daerah dataran tinggi dengan jenis tanah Alluvial Hidromorf Grumosol Kelabu Tua, dan memiliki posisi astronomis antara :6o50‘– 7o10’ Lintang Selatan dan 109o35’ -110o50’ Bujur Timur.